Докато екипът продължава да изследва Атлантис, внезапно освобождават злокобно същество, което заплашва да източи останалия запас от енергията на града. Извънземен нашественик се е промъкнал в града, застрашавайки сигурността на базата. Експериментите с извънземни на д-р МакКей, го вкарват в беда.